Le traitement des données est effectué au moyen du micro-ordinateur du projet en utilisant le tableur LOTUS. Une feuille de calcul a été préparée (ANNEXE 2), elle est remplie chaque mois avec les informations recueillies quotidiennement par les enquêteurs.
Le calcul de la capture moyenne par unité et l'extrapolation à l'ensemble du lac se font sur une base journalière. On peut de la sorte se rendre compte des variations d'abondance ou des phénomènes affectant localement la capture. Parallèlement les débarquements aux centres du projet et le nombre d'unités y ayant contribué sont aussi notés pour permettre des comparaisons.
L'estimation des captures totales mensuelles suit les étapes cidessous
| Taux d'activité: |  | (1) | |
| UEPa | = Nombre des UEP actives | ||
| UEPe | = Nombre des UEP présentes sur les sites d'enquêtes | ||
| Capture moyenne journalière par UEP active: | |||
 | (2) | ||
| Qa | = Quantité pêchée par toutes les unités actives | ||
| UEPa | = Nombre d'unités actives le jour considéré | ||
| Capture journalière dans tout le lac: | |||
| Cjlac = Cj × Ta × UEPt | (3) | ||
| Cj | = Capture moyenne journalière par UEP active | ||
| Ta | = Taux d'activité | ||
| UEPt | = Nombre total d'UEP opérant sur tout le lac | ||
| En combinant les expressions 1 2 et 3 on obtient: | |||
 | (4) | ||
| Capture totale mensuelle dans le lac: | |||
| Σ Cjlac | (5) | ||
| Cjlac | = Capture journalière dans tout le lac | ||
Cette estimation des captures totales est donc établie sur la base de captures énchantillonnées sur les UEP trimarans et catamarans, il faut ensuite lui ajouter les captures effectuées par les bateaux pratiquant d'autres types de pêche comme la senne tournante et notamment celles du senneur du projet PLK au Zaïre et celles de l'ISAMBAZA FAO 99 et du RWOGANYANJA FAO 128 au Rwanda.
Les UEP débarquant dans les centres du projet ne sont pas prises en considération en tant qu'unités enquêtées pour le calcul de la capture moyenne par UEP et par nuit, car on a précisément des doutes sur le fait que leurs débarquements représentent la capture. D'autre part il peut aussi arriver que les capture de plusieurs unités soient regroupées dans un même débarquement.
