في أبريل/ نيسان 2016، تبنت هيئة تدابير الصحة النباتية التابعة للاتفاقية الدولية لوقاية النباتات أول مبادرة رسمية اقترحتها فنلندا لإعلان عام 2020 السنة الدولية لصحة النبات.
بعد الموافقة على قرار السنة الدولية للصحة النباتية من قبل الدورة الأربعين لمؤتمر منظمة الأغذية والزراعة في يوليو / تموز 2017، أبلغ المدير العام لمنظمة الأغذية والزراعة الأمين العام للأمم المتحدة بالقرار وطلب عرض القرار في الدورة التالية للجمعية العامة للأمم المتحدة.
لدعم إعلان السنة الدولية للصحة النباتية، أنشأت لجنة تدابير الصحة النباتية اللجنة التوجيهية للسنة الدولية لصحة النبات التابعة للاتفاقية الدولية لوقاية النباتات في عام 2016، والتي عملت لاحقًا كمجلس استشاري تقني لـلسنة الدولية لصحة النبات كان المجلس بمثابة مجموعة من المعارف والخبرات، ومراجعة المنشورات التقنية، والمساعدة في تطوير مواد الاتصال، والعمل كلجنة برنامج للمؤتمر الدولي لصحة النبات، وتطوير الإجراءات الصادرة عن تلك اللجنة.
في 21 ديسمبر / كانون الأول 2018، صوتت الجمعية العامة للأمم المتحدة بالإجماع على إعلان عام 2020 السنة الدولية للصحة النباتية وفوضت منظمة الأغذية والزراعة، بالتعاون مع الاتفاقية الدولية لوقاية النباتات، لتسهيل تنفيذها.
في عام 2019، أنشأت منظمة الأغذية والزراعة وأمانة الاتفاقية الدولية لوقاية النباتات اللجنة التوجيهية الدولية للسنة الدولية للصحة النباتية لتوجيه تطوير وتنفيذ خطة عمل السنة الدولية للصحة النباتية، ولتحفيز الحوار مع الشركاء، وللمساعدة في حشد الدعم السياسي والمالي للسنة الدولية للصحة النباتية. كانت اللجنة التوجيهية تضم 18 عضوًا: 7 ممثلين من المجموعات الإقليمية السبع لمنظمة الأغذية والزراعة، و 7 مناوبين، وعضوان من المكتب الاستشاري التقني للسنة الدولية (الرئيس ونائب الرئيس)، و 7 ممثلين من وكالات الأمم المتحدة والمنظمات الدولية. كما تم تمثيل المجموعات الجغرافية والاقتصادية للدول، والمنظمات الإقليمية لوقاية النباتات، والأوساط الأكاديمية، ومنظمات البحوث الزراعية الدولية، ومنظمات المجتمع المدني، ومنظمات المزارعين العالمية، والقطاع الخاص وشركاء الموارد. بالإضافة إلى ذلك، تمت دعوة المكاتب الإقليمية لمنظمة الأغذية والزراعة لحضور اجتماعات اللجنة التوجيهية بصفة مراقب.
عقدت اللجنة التوجيهية الدولية للسنة الدولية للصحة النباتية اجتماعها الأول في 14 يونيو/ حزيران 2019 في المقر الرئيسي لمنظمة الأغذية والزراعة في روما، إيطاليا، واجتمع 18 مرة للإشراف على تنفيذ خطة عمل السنة الدولية للصحة النباتية.
بسبب جائحة كوفيد- 19، قررت اللجنة التوجيهية الدولية تمديد السنة الدولية لصحة النبات الرسمي حتى 1 يونيو/ حزيران 2021.