Бывают важные синергетические эффекты и компромиссы, которых невозможно добиться в рамках узкоотраслевых стратегий и инвестиций. Например, выращивание культур для производства биотоплива в богарных или орошаемых системах может способствовать улучшению энергоснабжения, но при этом приводить к усилению конкуренции за земельные и водные ресурсы, что скажется на местной продовольственной безопасности. Строительство плотин для гидроэлектростанций полезно с точки зрения производства энергии и обеспечения возможности хранения воды для орошения и бытовых нужд, но может быть сопряжено с вынужденным переселением людей и ухудшением ситуации с доступностью воды в агроэкосистемах, расположенных ниже по течению. Эти и другие аналогичные проекты выиграли бы от усиления координации в связке "водоснабжение – энергетика – продовольствие", поскольку это обеспечило бы наиболее эффективное использование ресурсов.
Многочисленные уроки были извлечены из трагической истории с высыханием Аральского моря в Центральной Азии: там водные ресурсы подверглись чрезмерной эксплуатации в связи с необходимостью орошения хлопковых полей. Это создало избыточную нагрузку на водные ресурсы, вызвав засоление, загрязнение верховий рек сельскохозяйственными химикатами и отходами горнодобывающей промышленности, а также утрату водных видов и рыбного промысла и связанных с этим источников средств к существованию.